Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms