Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 C14orf177-201ENST00000325812 1284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RNA5SP250-201ENST00000362534 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL157895.1-203ENST00000423551 708 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 C2orf74-202ENST00000426997 879 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC092447.7-202ENST00000443198 580 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 KCNAB1-AS1-201ENST00000467794 456 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC091152.1-201ENST00000472109 838 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 C12orf73-203ENST00000546540 590 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009432.1-201ENST00000560391 648 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC068620.2-201ENST00000602927 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 pRNA.10-201ENST00000613590 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 MIR7113-201ENST00000621222 59 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMEM258P61165 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms