Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms