Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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