Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SREBF2Q12772 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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