Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCSER1Q9C0I3 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms