Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC93Q567U6 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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