Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
RAB39AQ14964 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms