Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms