Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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HOXD10P28358 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD10P28358 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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