Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VPREB1P12018 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms