Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLDN9O95484 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CLDN9O95484 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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