Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CCSER1Q9C0I3 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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