Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TOP3AQ13472 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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