Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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TCOF1Q13428 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TCOF1Q13428 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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