Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SRSF5Q13243 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms