Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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HOXA13P31271 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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HOXA13P31271 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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