Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms