Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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