Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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