Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP53609 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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