Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LRRTM2O43300 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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