Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RFXAPO00287 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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