Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms