Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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LINC00587B1AMM8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
LINC00587B1AMM8 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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