Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vstm4T1NXB5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms