Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Top3bQ9Z321 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top3bQ9Z321 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms