Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SnapinQ9Z266 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms