Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn8Q9Z260 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms