Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod2Q9R0B9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms