Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms