Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Copg1Q9QZE5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copg1Q9QZE5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms