Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Slco1a1Q9QXZ6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slco1a1Q9QXZ6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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