Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nufip1Q9QXX8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms