Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpsf3Q9QXK7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpsf3Q9QXK7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms