Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms