Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek6Q9ES70 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms