Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms