Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fundc1Q9DB70 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms