Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms