Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms