Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rep15Q9D7T1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rep15Q9D7T1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rep15Q9D7T1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rep15Q9D7T1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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