Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D7E4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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