Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gabra4Q9D6F4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms