Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc39Q9D5Y1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms