Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc7Q9D0M0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc7Q9D0M0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms