Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Utp11Q9CZJ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms