Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc77Q9CZH8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms