Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gtpbp8Q9CY28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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