Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ist1Q9CX00 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ist1Q9CX00 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms